隨著具有廣泛耐藥性的超級耐藥細(xì)菌的出現(xiàn),人類迫切需要結(jié)構(gòu)新穎的抗生素。最近,加拿大麥克馬斯特大學(xué)和美國斯坦福大學(xué)的研究人員開發(fā)出一種新的生成式人工智能模型,可以快速、低成本地設(shè)計新的抗生素分子,并給出了合成路線,使化學(xué)家們可以在實驗室輕松合成出新分子。3月22日,相關(guān)成果發(fā)表于《自然—機(jī)器智能》。
2022年的一項全球性研究顯示,2019年全球約有127萬人直接死于抗生素耐藥性。
“抗生素是一種獨(dú)特的藥物。一旦我們開始在臨床上使用它們,就啟動了藥物失效計時器,因為細(xì)菌會迅速進(jìn)化以抵抗它們?!痹撜撐牡闹饕髡摺Ⅺ溈笋R斯特大學(xué)助理教授Jonathan Stokes表示,“我們需要快速且廉價地發(fā)現(xiàn)抗生素,這就是人工智能發(fā)揮關(guān)鍵作用的地方,”
此前,人工智能模型在開發(fā)抗生素方面存在明顯的局限性:性質(zhì)預(yù)測模型在評估某一種化學(xué)性質(zhì)時,需要挨個評估不同分子,擴(kuò)展性較差;而生成模型雖然可以快速設(shè)計多種分子,但生成的分子往往難以在實驗室合成。
研究人員設(shè)計了一種人工智能生成模型SyntheMol,并選取超級耐藥細(xì)菌——鮑曼不動桿菌來進(jìn)行試驗。這是一種很難根除的細(xì)菌,已被世界衛(wèi)生組織確定為世界上最危險的耐藥細(xì)菌之一。
他們從包含13.2萬個分子片段的數(shù)據(jù)庫中提取數(shù)據(jù),這些片段可以像樂高積木一樣無縫銜接,但性質(zhì)卻截然不同。然后將這些分子片段與一組13 個化學(xué)反應(yīng)進(jìn)行交叉驗證,從而獲得300 億個片段的雙向組合,從中設(shè)計出58個最有前景的新分子,并利用另一個人工智能毒性預(yù)測模型來測試新分子的毒性。
在隨后的實驗室研究中,他們合成了這些結(jié)構(gòu)新穎的分子,并驗證其中6個新分子表現(xiàn)出對鮑曼不動桿菌和其他幾種細(xì)菌病原體的有效抗菌活性,而且無毒。
“Synthemol 不僅設(shè)計了有前途的候選藥物的新穎分子,而且還生成了如何制造每種新分子的配方。這是一種新方法,也是游戲規(guī)則的改變者,因為化學(xué)家往往不知道如何制造人工智能設(shè)計的分子?!闭撐暮现摺⑺固垢4髮W(xué)副教授James Zou說。
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